『SPY×FAMILY』のアーニャとボンドは、物語の主人公である。アーニャは、超能力を持つエージェントであり、ボンドは、偽造家族を作ってスパイ活動を行うスパイである。物語は彼らが、偽造家族を作ってスパイ活動をする中で、様々な人々と出会い、様々な事件に巻き込まれながら、成長していく姿を描いている。

アーニャは、超能力を持つことから、周りの人々とは異なる存在感を持っている。彼女は、テレパシー能力を持っており、他人の心を読むことができる。しかし、その能力のせいで、周りの人々に対して距離感を持ってしまい、孤独を感じることが多い。しかし、偽造家族を作ることで、新しい家族を得ることができ、人々とのつながりを深めることができるようになっていく。

一方、ボンドは、スパイとしての能力に長けており、偽造家族を作ることで、様々な情報を集めることができるようになる。彼は、自分の過去に悩みながらも、アーニャや娘のスルーと共に、偽造家族として暮らす中で、新しい家族を作ることができるようになっていく。

『SPY×FAMILY』は、2人の異なる能力を持つ主人公が、偽造家族として共同生活を送りながら、様々な事件に巻き込まれるストーリーである。彼らが、家族として成長していく姿は、非常に感動的である。